Cy3.5 (Cyanine 3.5) 是一种发红色荧光的花青素类荧光染料。Cy3.5在显影时可以用561nm或者594nm的激光束激发然后用 Texas Red® 相似的滤片观察，它是一种非常常用的标记染料。Cy3.5可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸分子，纳米粒等。
炔烃(alkyne)是常用生物标记基团。通过铜催化点击化学反应(Copper-catalyzed azide–alkyne cycloaddition, CuAAC)，炔烃可以和叠氮(azide)生成稳定的生物链接(bioconjugate)。点击化学反应效率很高，可在水相中(也可有机相)快速完成，即便在低浓度(μM)下。点击化学反应技术发展很成熟，各种相关试剂商业可得，各种生物标记应用。
Cy3.5标记后的产物Ex/Em是591nm/604nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Texas Red®，Alexa Fluor 594, BODIPY® TR, DyLight 594等。 
英文名：Cyanine3.5 alkyne
Cy3.5 alkyne
中文名：花青素CY3.5炔基
性 状：深紫色固体
分子量：630.26
分子式：C41H44ClN3O
溶解性：可溶于氯仿，甲醇，乙腈，DMF等有机溶剂，微溶于水
ex/em：591/604 nm (PBS缓冲液)
消光系数(ε)：116000 L⋅mol−1⋅cm−1
质量控制：纯度>95%
储存条件：在-20°C中24个月。
运 输：室温下长达3周。避免长时间接触光线。变干。
注意事项：
Cy3.5-炔烃水溶性较低，如需在水相中标记可选择磺化Cy3.5-炔烃( D10022 )。
标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊(photobleaching)
其他活性荧光染料产品目录 
CY5-COOH
CY5-NHS ester  
CY5-amine
CY5-azide
CY5-alkyne
CY5-hydrazide
CY5-maleimide
CY5-Thiol
Sulfo-CY5-carboxylic acid
Sulfo-CY5-NHS ester  
Sulfo-CY5-amine
Sulfo-CY5-azide
Sulfo-CY5-alkyne
Sulfo-CY5maleimide
Sulfo-CY5-hydrazide
Sulfo-CY5-Thiol
CY5.5-carboxylic acid
CY5.5-NHS ester  
CY5.5-amine
CY5.5-azide
CY5.5-alkyne
CY5.5-maleimide
CY5.5-hydrazide
CY5.5-Thiol
Sulfo-CY5.5-COOH
Sulfo-CY5.5-NHS ester  
Sulfo-CY5.5-azide
Cy(Cyanine)是一系列非常常用的荧光化合物。它们荧光比FITC，罗丹明等更亮更稳定，在工业和生物技术中已有很多年的使用历史。基于不同的化学结构，Cy染料的荧光可以覆盖从紫外到近红外几乎所有光谱。