磺化Cy3是Cy3(Cyanine 3)的水溶型。它的光谱性质和Cy3类似，在荧光显微镜下发橘黄色荧光。它的荧光很亮，并且对pH不敏感，一般可以用530nm-561nm的激光束激发然后用 TRITC (tetramethylrhodamine) 的滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。标记后，样品背景荧光一般认为比TAMRA等系列的染料低。 磺化Cy3可以用来标记蛋白，抗体，多肽，核酸等各种生物分子。
马来酰亚胺(maleimide)是生物标记反应中常用的基团，它可以和巯基(-SH)通过亲和加成反应生成稳定的巯醚(thioester)结构从而实现标记。尽管胺基(比如赖氨酸精氨酸侧链)也有亲和性，但在中性或微酸性缓冲液中，马来酰亚胺选择性标记巯基(反应速度比胺基快>1000倍)。标记反应反应迅速，选择性高，产率好，另外，巯基是一种在生物分子中存在的官能团，比如蛋白中的丝氨酸(cysteine)和双硫键等，因此马来酰亚胺/巯基(maleimide/thiol)标记已成为仅次于NHS/胺基标记的常用生物连接反应(bioconjugation)。
磺化Cy3-马来酰亚胺的水溶性极高，所以在标记反应中不需要使用有机共溶剂，特别适合标记对有机溶剂敏感的生物分子。另外磺化Cy3水溶性极好，并且染料分子本身带电荷，标记到生物分子表面后不会引发疏水性聚集，提高荧光标记产物的稳定性。磺化Cy3-马来酰亚胺也溶于甲醇，DMSO，DMF等有机溶剂，标记反应也可以在纯有机溶剂中进行
磺化Cy3-马来酰亚胺标记后的产物Ex/Em是555/570nm。和它具有相似荧光特性的染料包括TAMRA，Alexa Fluor 555，DyLight 550，BODIPY® TMR-X等。
产品信息：
英文名称:Sulfo-Cyanine3 maleimide
Sulfo-Cy3 maleimide
中文名称:水溶性磺酸基-Cy3 马来酰亚胺
CAS No:1656990-68-9
性 状：红色粉末
分子量：776.96
分子式：C36H41KN4O9S2
溶解度：溶于水，DMF，DMSO
质量控制：纯度>95%
储存条件：在-20°C中24个月
运 输：室温下长达3周。避免长时间接触光线。变干。
Cy系列的活性基团菁染料：
N-羟基琥珀酰亚胺脂Dye NHS esters
§  Cyanine3 NHS ester
§  Cyanine3.5 NHS ester
§  Cyanine5 NHS ester
§  Cyanine5.5 NHS ester
§  Cyanine7 NHS ester
§  Cyanine7.5 NHS ester
§  Sulfo-Cyanine3 NHS ester
§  Sulfo-Cyanine5 NHS ester
§  Sulfo-Cyanine7 NHS ester
叠氮化物 Dye azides
§  Cyanine3 azide
§  Cyanine3.5 azide
§  Cyanine5 azide
§  Cyanine5.5 azide
§  Cyanine7 azide
§  Cyanine7.5 azide
§  Sulfo-Cyanine3 azide
§  Sulfo-Cyanine5 azide
§  Sulfo-Cyanine7 azide
马来酰亚胺 Dye maleimides
§  Cyanine3 maleimide
§  Cyanine5 maleimide
§  Cyanine5.5 maleimide
§  Cyanine7 maleimide
§  Cyanine7.5 maleimide
§  Sulfo-Cyanine3 maleimide
§  Sulfo-Cyanine5 maleimide
§  Sulfo-Cyanine7 maleimide
炔烃 Dye alkynes
§  Cyanine3 alkyne
§  Cyanine5 alkyne
§  Cyanine5.5 alkyne
§  Cyanine7 alkyne
§  Cyanine7.5 alkyne
§  Sulfo-Cyanine3 alkyne
§  Sulfo-Cyanine5 alkyne
§  Sulfo-Cyanine7 alkyne
胺基Primary amine
§  Cyanine3 amine
§  Cyanine5 amine
§  Cyanine5.5 amine
§  Cyanine7 amine
§  Cyanine7.5 amine
§  Sulfo-Cyanine3 amine
§  Sulfo-Cyanine5 amine
§  Sulfo-Cyanine7 amine
羧酸 Carboxylic acids
§  Cyanine3 carboxylic acid
§  Cyanine3.5 carboxylic acid
§  Cyanine5 carboxylic acid
§  Cyanine5.5 carboxylic acid
§  Cyanine7 carboxylic acid
§  Cyanine7.5 carboxylic acid
§  Sulfo-Cyanine3 carboxylic acid
§  Sulfo-Cyanine5 carboxylic acid
§  Sulfo-Cyanine7 carboxylic acid
Sulfo-Cyanine3 maleimide,1656990-68-9, SF Cy3-MAL